Galaxy

         Découvert pendant mon stage de fin de master 1 auprès de Julien de Lorgeril et avec l'enseignement de Jérémie Vidal-Dupiol .

         Cette plateforme d'analyse bioinformatique sans ligne de commande m'a servi à préparer et analyser des séquences de RNAseq du chargement des données jusqu'à la comparaison de transriptomes selon les conditions expérimentales avec l'outils DESeq2 (Determines differentially expressed features from count tables (Galaxy Version 2.11.39), Love et al., 2014 )

Compétences

  • Comprehension des outils utilisés
  • Utilisation de l'outils Line, Word, Caracter count
  • Utilisation de l'outils Concatenate Data set
  • Utilisation de l'outils FastQC Report